小兒腦炎的表現是輕重不一，主要表現在神經系統方面的異常表現為發熱、頭痛、嘔吐、嗜睡、昏迷、驚厥等。嚴重的大腦、丘腦的下部、丘腦下部、腦幹、小腦和脊髓的部位可能會出現異常的表現，精神異常表現為興奮多語、煩躁不安、哭笑無常、失眠、行為異常、幻覺或者表情的淡漠、活動減少、不吃、定向力差、記憶力減退、大小便失禁等等。有的孩子還可能會出現胃腸道的一些表現比如說出現噁心，嘔吐，腹瀉等等。