狹顱症的典型症狀是出現各種不同形狀的頭顱畸形、神經功能障礙和顱內壓增高、眼部症狀和合並畸形等表現。除此之外，部分患者還會出現高顱壓、腦萎縮、視神經萎縮、傳導性聽力下降等。該病還會導致對稱性並指/趾畸形，以及唇裂、顎裂，先天性心臟病及外生殖器異常等併發症。
一、典型症狀
1、頭部畸形：矢狀縫過早閉合，形成舟狀頭或長頭畸形，兩側冠狀縫過早閉合，形成短頭或扁頭畸形；一側冠狀縫過早閉合，形成斜頭畸形，額縫過早閉合，形成三角顱。所有顱縫均過早閉合，形成尖頭畸形或塔狀頭，需要與頭小畸形鑑別。
2、神經功能障礙和顱內壓增高：部分病兒可有智能低下。視力障礙較為常見，晚期發生視神經萎縮、視野缺損甚至失明。顱內高壓症候多不典型。
3、眼部症狀和合並畸形：眼部徵象包括眼球突出、眼球內陷、眼距異常、斜視等。常合併身體其他部位畸形，如並指(趾)、膊裂、唇裂及脊柱裂等。
4、全顱縫早閉：如全部顱骨骨縫均發生提前閉合，表現為小頭畸形、顱頂扁平、顱矢狀徑、顱冠狀徑、頭圍乃至整個頭顱均顯著小於同齡上常人，多伴有其他部位的發育異常。因腦部發育嚴重受限，患兒智力發育較差。
5、額縫早閉：額縫早閉可致三角頭畸形，後者有兩種類型，一種為眶上緣正常，一種為眶上緣後縮，前額正中呈龍骨踏狀，從頭頂觀前額部三角頭畸形尤為明顯，可捫及額部正中早閉顱縫聞，可伴有眶距過狹症和內眥贅皮，部分患者有慢性顱內壓增高徵象。
二、其他症狀
晚期可有頭痛、噁心、嘔吐等。部分病人可因上呼吸道阻塞而出現通氣不足、睡眠性呼吸暫停。若出現顱內壓增高，臨床表現隱匿，包括頭痛、興奮和睡眼困難，未經治療的顱內壓增高可導致視乳頭水腫、視神經菱縮以至失明等症狀。若出現腦組織受壓，會引起神經心理障礙，從輕徽行為錯亂直至顯著的弱智，也包括嗅覺喪失、視力減退、面部敏感性改變、三叉神經痛等。