器質性性功能障礙，它是除外心理因素導致的性功能障礙，其可能合併有器官的本身病變。它包含的範圍非常廣，比如常見的早洩、陰莖起勃功能障礙、不射精、逆行射精、陰莖異常勃起等疾病。以陰莖異常勃起為例，它通常分為低流量型及高流量型。對於低流量型陰莖異常勃起，可以使用非手術治療。比如，對陰莖給予冰敷，鎮靜，止痛等處理，必要時靜脈輸入低分子右旋糖酐，一般會有效。對於高流量型，其保守治療措施一般和低流量型相同，若非手術治療無效，則可以手術治療，一般採用海綿體抽吸放血或動脈栓塞療法。