導致輸精管阻塞的病因及部位不同，其治療方法也不同。因生殖道炎症引起的射精管口水腫，一般不需要手術，經過抗感染及物理治療，控制炎症水腫消退，多數可恢復通暢，但這種情況只有在急性炎症期才有效。如果堵塞部位在輸精管，可行堵塞段切除後端端吻合術，病變在附睪尾部者可採用輸精管附睪吻合術。射精管口堵塞所造成的阻塞性無精子症，可以選擇經尿道射精管切開手術進行治療。還可以採用輸精管道穿刺取精，進行配偶間的人工授精治療。