梅毒的硬下疳，需要和軟下疳、生殖器皰疹、固定性藥疹、白塞氏病等等進行鑑別。梅毒硬下疳的特點是在高危的性行為之後2-4周，在接觸部位，通常是在外生殖器、肛周部位首先出現小的紅斑，很快就變成硬結、潰瘍，形成硬下疳的皮損。它的特點主要是質地相對比較硬，表面有少許的漿液性分泌物，沒有自覺症狀，不疼不癢。
軟下疳由杜克雷嗜血桿菌感染引起，也發生在外生殖器部位，但是往往比較淺表，質地比較軟，而且疼痛劇烈。另外像生殖器皰疹，初發主要是群集性水皰，破潰之後形成淺的糜爛面，會有癢和痛的感覺，和梅毒硬下疳有顯著不同。