根據扁平疣的體積大小以及部位選擇不同的治療方法，主要包括保守治療和激光治療。如果扁平疣的體積較大，數量比較少，長在了臉上影響美觀，可以採用激光的方法來祛除，激光治療是能夠徹底根除扁平疣的。如果長在了比較隱蔽的地方，且數量較多，體積較小，應該採取保守治療，主要是通過注射抗病毒藥物抑制病毒複製，常用藥物包括胸腺肽、干擾素。