火針治療扁平疣效果非常好，但是一定要注意火針治療的操作流程，不能盲目的用火針治療。還有如果是瘢痕體質的人，儘量不要用火針治療，容易產生瘢痕。火針治療以後要注意防水，防止感染。
火針治療扁平疣主要依靠火針的熱效應，火針燒紅以後刺在扁平疣上，扁平疣瞬間碳化，這樣扁平疣就脫落了。另外，火針刺激扁平疣部位的皮膚，可以促進此處皮膚免疫功能增強，促進皮膚屏障功能增強，這樣能夠抵抗病毒侵入。所以火針治療扁平疣，一方面是把現存的扁平疣給灼燒掉，另一方面增強局部的免疫功能，這樣能夠抗病毒。