毛髮的毛囊炎其實也就是指頭皮的毛囊炎，要根治就要養成良好的生活習慣，避免熬夜、上火，以及保證充足的睡眠和休息，保持良好機體免疫狀態。飲食要清淡，少吃一些辛辣刺激的食物，避免大量飲酒，都可以使局部毛囊細菌繁殖引起毛囊炎。另外，如果是患有一些基礎疾病，特別是像糖尿病、肝病、腎功能不全等等導致機體免疫力下降，就比較容易發生毛囊炎，需要積極控制。
對於毛囊炎本身，輕度可以使用外用抗菌藥物，比如夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏、紅黴素軟膏等進行治療。嚴重的可以考慮口服抗菌素，比如頭孢類、青黴素類、大環內酯類抗菌素口服治療，療程要足量，才能將毛囊的細菌徹底殺滅，使其不容易復發。另外頭皮部的清潔衛生也很重要，患者要定期清潔頭皮，避免細菌滋生。另外也不要過度的搔抓、燙洗，造成皮膚損傷，否則細菌也容易經損傷部位感染，引起毛囊炎。