皰疹性口腔炎在六歲以下的兒童多見，分為四個期，具體如下：
1、前驅期，潛伏期4-7天以後，出現發熱、頭痛、疲乏不適、全身肌肉疼痛，甚至咽喉腫痛等急性症狀，頜下或者頸上的淋巴結腫大、觸痛，1-2天以後口腔黏膜廣泛的充血、水腫。
2、水皰期，在口腔黏膜的任何部位皆可以發生成簇的小水皰，似針頭大小，特別是鄰近乳磨牙的顎部或者齦緣處更加明顯，水皰壁薄、透明，不久就破潰形成淺表潰瘍。
3、糜爛期，儘管水皰較小，但彙集成簇，破壞以後可以形成大面積的糜爛，造成繼發感染，上面可以被覆著黃色的假膜，皰壁破潰後也可以結痂。
4、癒合期，糜爛面逐漸縮小、癒合，整個病程約7-10天。