複發性的口腔潰瘍，也叫複發性阿弗他潰瘍、複發性口瘡、複發性阿弗他口炎。病因不是很明確，存在明顯的個體差異，學術界一般的看法是，它是多種病因綜合作用的結果。病因包括一下幾點：
第一、免疫因素，細胞免疫異常、體液免疫異常、自身免疫異常；
第二、遺傳因素；
第三、系統性疾病因素，複發性阿弗他潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、侷限性腸炎、肝膽疾病等密切相關；
第四、環境因素，生活工作環境、社會環境、心理環境等，都與複發性阿弗他潰瘍相關；
第五、其他因素，體內氧自由基的產生和清除失調、微循環障礙等，都與複發性阿弗他潰瘍相關。