腳氣是皮膚癬菌侵犯足部皮膚所引起的，是真菌感染性的皮膚病，甲硝唑是抗厭氧菌的藥物，並不治療腳氣。對於腳氣的治療，患者需要口服或者是外用抗真菌感染的藥物，常用的外用藥有萘替芬酮康唑乳膏，特比萘芬乳膏，盧立康唑乳膏等；口服藥有伊曲康唑或者是特比萘芬。甲硝唑可以用於面部毛囊蟲感染或者是痤瘡等細菌感染性皮膚病，用其治療真菌感染是無效的。