目前在臨床中病毒性心肌炎的臨床診斷，主要依據包括有以下幾點：1、發病前有胃腸道感染或呼吸道感染病史；2、心臟損害的各種臨床表現，以及心肌損傷標誌物陽性。3、其它輔助檢查，如心臟超聲、心電圖提示有心肌損傷；4、病原學檢查陽性等等。如果含有上述以上的主要診斷依據為陽性，則應該考慮病毒性心肌炎的可能。
如果確診病毒性心肌炎，則需要依靠心內膜的心肌活檢，當診斷明確時就要對病毒性心肌炎進行積極的治療。目前在臨床中沒有特異性的治療手段，主要針對於病毒感染和心肌炎症的治療，要充分的休息，清淡的飲食，進食富含有蛋白質、易消化的飲食。如果病情需要，則需要進行抗病毒治療。營養心肌的治療包括維生素C、輔酶Q10，以及多種維生素等，嚴重的心肌炎則需要糖皮質激素。