腦電圖在兒科主要應用於癲癇、小兒驚厥、腦炎的診斷及評估患兒的預後。小兒出現四肢抽搐、口吐白沫、意識喪失、小便失禁等情況，應及時給予腦電圖檢查，有助於進一步診斷癲癇及小兒驚厥。有的患兒癲癇發作次數較少，普通腦電圖不容易記錄大腦異常放電波。這種情況下，可以選擇動態腦電圖或者視頻腦電圖，提高陽性率。腦炎的患兒也可以行腦電圖檢查，前後腦電圖的對比可以明確患兒病情是好轉還是加重，有助於判斷疾病的預後。