咳嗽變異性哮喘的治療原則與典型哮喘治療相同，大多數患者可以選入吸入的低劑量的ICS聯合長效的β2受體激動劑，或者口服白三烯調節劑、緩釋茶鹼類，必要時可以口服小劑量激素治療，療程可以短於典型的哮喘。
咳嗽變異性哮喘也可以採用免疫療法，分特異性免疫和非特異性免疫，特異性免疫是指哮喘患者對某種變應原耐受性增高，再次接觸此類變應原之後，不再誘發哮喘症狀，非特異性免疫包括注射卡介苗、口服轉移因子、疫苗等。還有哮喘病人的教育與管理，要正確的管理哮喘患者，提高病人的生活質量，為每位初診的哮喘患者制定長期的計劃，使病人在醫生和專業護士的指導下學會自我管理，減少或者是減輕誘發因素，熟悉哮喘發作的表現以及處理辦法。