甲型流感起病比較急，病情進展比較迅速，一般在第二天各種症狀會表現更為突出，尤其對於合併重症流感、合併肺炎的患者，在第二天就可以使病情迅速加重，可以出現高熱、咳嗽、氣促、呼吸困難。有些患者缺氧比較明顯，可以表現為紫紺。
如果病情不能夠及時得到控制，病情繼續進展，可以出現Ⅰ型呼衰，嚴重的可以出現ARDS，再嚴重的患者可以出現呼吸循環衰竭。所以對於甲型流感的患者，尤其本身有基礎疾病或者孕婦、有嚴重的免疫功能低下的患者，需要儘早應用抗流感的藥物，否則病情進展迅速，很快會引起肺炎，嚴重的患者可以導致呼吸循環衰竭。