普通感冒和流感雖然都是病毒感染引起來的，但是差異還是比較大的。普通感冒是最常見的毒力比較輕的病毒感染，像鼻病毒、腺病毒或者呼吸道合胞病毒等，相對來說是毒力比較輕的病毒感染，可能就表現為上呼吸道卡他症狀，比如鼻塞、流鼻涕、咽疼，可能會伴有全身症狀，有低熱、乏力，基本上有一定的自愈性，5-7天大部分都會好轉，或者服用中藥輔助治療，症狀比較輕微，很少引起比較惡性的併發症，像心肌炎。如果得到充分的休息，相對來說比較少。
流感就不同，流感是比較重的流感病毒，有很明顯的季節性，症狀也比較重，發病比較快，症狀是高熱、全身的肌肉關節疼，有些伴有頭疼、腰疼，反而卡他症狀可能並不是特別重，像打噴嚏、流鼻涕症狀不是特別重。基本上會建議患者查甲流、乙流，有些抗流感的藥物越早期應用越好，像奧司他韋，早期應用抑制病毒的複製效果會好些。有些症狀可能會引起併發症，像病毒性肺炎，比較危重的病理也有，需要及時的治療監測。