兒童支原體肺炎，一般主要採用對症治療和病因治療為主。針對於陣發性長期的刺激性的乾性咳嗽，可以使用止咳化痰的藥物比如複方非那根糖漿、氨溴索咳糖漿、複方氨溴特羅口服溶液等。還可以用糖皮質激素，比如布地奈德霧化液霧化吸入，緩解症狀。抗支原體治療可選擇使用大環內酯類藥物，比如阿奇黴素、紅黴素等。一般針對於輕度的肺炎，可以不需要特殊處理，能夠在兩週以內自愈。