支原體肺炎的治療首選藥物，根據情況而定。支原體肺炎由於感染了肺炎支原體而引起來的肺炎。而肺炎支原體是一種沒有細胞壁的病原微生物，一般的抗生素的作用機制都是通過作用於細菌的細胞壁，干擾細菌的代謝起到殺菌或抗菌的作用，所以，對於肺炎支原體沒有作用殺滅作用。因此，臨床上多選擇大環內脂類抗生素或者人工喹諾酮類抗生素。兒童支原體肺炎治療首選阿奇黴素；成人支原體肺炎治療則首選左氧氟沙星。