支原體肺炎引起的原因，主要是因為感染肺炎支原體引起。健康人通過吸入患者咳嗽、打噴嚏時噴出的分泌物而感染肺炎支原體，引起呼吸道及肺部的炎症。肺炎支原體通常存在於呼吸道粘膜，通過粘附和釋放毒性物質，導致呼吸道及肺部損傷，並可進一步誘發機體免疫反應。嚴重者可對皮膚、心臟、血液系統、神經系統、消化系統等全身多臟器造成損害。引起的損傷程度與感染的支原體數量有關。當有營養不良、免疫功能低下時容易發病；呼吸道疾病恢復期的患者容易發病；空氣流動差，人員密切接觸，可導致發病率增高。