治療慢性淺表性胃竇炎，首先應該去除病因。合理飲食，主食多元化，不要吃刺激性較大的食物，不要喝濃茶，戒除菸酒，少吃油炸醃製和燻烤的食物。同時還應該選擇抗幽門螺旋桿菌感染的抗生素。可以使用氨苄青黴素配合克拉黴素、替硝唑，堅持用藥7～10天，重新進行呼氣試驗檢查。根據具體症狀，選擇抑制胃酸分泌或者是促進胃腸道蠕動的藥物對症治療。