秋季過敏性咳嗽主要是抗過敏治療為主，可以在季節轉換之前2個月左右提前口服白三烯受體拮抗劑孟魯司特鈉緩解氣道內炎症，以及可以使用霧化吸入糖皮質激素減輕氣道內高反應性。患者也可以在過敏性咳嗽發作的時候口服抗組胺類藥物，例如酮替芬、氯雷他定、西替利嗪等。如果單純使用布地奈德吸入劑效果不佳或者夜間咳嗽頻繁，可以吸入糖皮質激素混合支氣管擴張劑。如果咳嗽劇烈，可以在醫生指導下口服鎮咳類藥物，例如右美沙芬、可待因等。