橋本甲狀腺炎有相當一部分病人，可以伴有輕度的甲亢或者甲減以後，又恢復到正常的甲狀腺功能狀態，這種情況叫橋本甲狀腺炎的自限性。這種自限性通俗的說會自己好，沒有通過藥物特殊的控制，橋本甲狀腺炎的自限性使病情穩定，就是自我的恢復，這種情況在一定環境、條件的促發下有可能復發。
因為橋本甲狀腺炎就是自身免疫性疾病，自身免疫性疾病往往跟患者個體的自身免疫遺傳缺陷有一定關係，也就是橋本甲狀腺炎的自限性表現是甲狀腺炎恢復到正常的時候，但是潛在的再發病體質也存在。如果遇到病毒感染、自身免疫功能紊亂，有某些誘發因素存在的時候，又會觸發自身免疫的疾病。這種自身免疫疾病發生在甲狀腺，會導致橋本甲狀腺炎疾病的復發。橋本甲狀腺炎自愈後有一定的程度會復發，所以橋本甲狀腺炎要想預防不復發，就要保持正常的生活狀態，要提高免疫力、避免感染等等情況，努力使自己有潛在遺傳風險的個體不再發生橋本甲狀腺炎，使復發風險降到最低。