自身免疫性甲狀腺炎是不能自愈的，它屬於慢性淋巴細胞性甲狀腺炎，是甲狀腺的自身免疫性疾病，是機體把甲狀腺當作抗原，產生針對自己的抗體，包括甲狀腺球蛋白抗體和甲狀腺微粒體抗體。在疾病的發病過程中，淋巴細胞逐漸代替甲狀腺組織，最終使甲狀腺功能減退症。從抗體升高到發生甲狀腺功能減退症，因人而異，時間長短不一。有些患者3-5年就發生甲狀腺功能減退症，有些患者終生都沒有發生。在沒有發生甲減時，只是抗體升高，只需要追蹤觀察，定期檢查抗體和甲狀腺功能。當發生甲狀腺功能減退症時，給予左甲狀腺激素替代治療，這個疾病是不能自愈的。