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系統性紅斑狼瘡患者最常損害的部位主要包括皮膚和黏膜，約80%的患者在系統性紅斑狼瘡病程中都會出現皮疹，這些皮疹包括全部呈蝶形分佈的紅斑、盤狀紅斑，蹠掌部、甲周部紅斑，另外口腔與鼻腔黏膜可以出現潰瘍，頭皮可以出現脫髮等情 況。
系統性紅斑狼瘡患者在疾病穩定，並且穩定了很長一段時間之後有停藥的可能，但具體怎麼停藥，要根據患者的病情來決定，在國際上沒有統一的答案。如果疾病較輕，只累及不太重要的器官或者臟器，包括只有皮膚黏膜的損害、皮疹、脫髮、口腔潰瘍， 或者關節肌肉的損害，這種情況下都認為患者的病情不是很重。如果治療之後患者的病情緩解，在病情穩定半年到1年之後可以嘗試停用藥物。
乾燥綜合徵不會轉成紅斑狼瘡，臨床上有部分特殊病例，特別是部分中老年發病的患者，在疾病的早期以口乾、眼乾等乾燥綜合徵的症狀為初發症狀，逐漸發展成紅斑狼瘡。這主要是由於乾燥綜合徵和系統性紅斑狼瘡這兩個疾病，在臨床表現和實驗 室檢查當中具有一定的重疊性，它們都屬於瀰漫性結締組織病，全身多臟器受累。
兒童紅斑狼瘡的治療只能控制病情，不能治癒。兒童紅斑狼瘡是指兒童包括青春期前後少年時期起病的系統性紅斑狼瘡，此病發病率比較高，臨床症狀比成人系統性紅斑狼瘡更為嚴重，而且發展迅速，預後也比較差。兒童紅斑狼瘡治療目標是控制，需要 長期觀察，而不是能簡單治癒。
紅斑狼瘡脫髮部分患者可以恢復，但首先需要使病情穩定。脫髮是紅斑狼瘡復發的臨床表現，此類患者的頭髮較稀疏，容易脫髮、容易折斷，所以需要積極的控制原發病。如果患者出現斑禿，恢復的可能性較小。所以臨床中碰見脫髮的患者，需要與狼瘡引起的脫髮和皮膚科引起的常見脫髮相鑑別。
對於紅斑狼瘡而言，無論是中醫治療還是西醫治療，目前僅可以達到很好的控制，但無法治癒。目前系統性紅斑狼瘡的發病，大部分與環境因素、遺傳基因，還有內分泌失調等有關係。所以紅斑狼瘡發病可能有多種機制，西醫可以很好的控制病情。