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華法林鈉片不治療腦血栓，但可以用於預防心肌梗死後房顫、心臟瓣膜病，或人工瓣膜置換術後引起腦栓塞的發生。腦血栓通常是指腦動脈由於局部血管自身病變，而激發血栓形成，導致血管壁增厚、管腔狹窄，或閉塞引起局部的血流減少，或供血中斷，腦組織缺血、缺氧、壞死 而出現的局灶性神經功能缺損症狀和體徵。而腦栓塞是指血中的各種栓子，如心臟內的附壁血栓、動脈粥樣硬化的斑塊、脂肪、腫瘤細胞、纖維軟骨，或空氣等，隨著血流進入到腦動脈而阻塞血管，引起的腦組織缺血性壞死，而出現的局灶性神經功能的缺損。
臨床沒有中醫中藥溶栓概念，目前尚未發現有明顯溶栓作用的單味中藥。中醫治療血栓類疾病，主要採用活血化瘀方法。活血化瘀的藥物種類較多，包括丹參、川芎、紅花、雞血藤、牛膝等。
水蛭治療血栓存在一定科學依據。水蛭是一種傳統中藥，具有較強的破血通絡作用，在活血化瘀藥物中作用最強。水蛭治療血栓疾病存在藥理基礎，其含有一種成分稱為水蛭素。目前發現，水蛭素對凝血酶具有最強的抑制作用，效果最強，因此水蛭 可以用於治療血栓類疾病，例如腦血栓、心血管疾病，還有下肢血管閉塞類疾病均可以選用。但應用水蛭時需要在醫生指導下進行，避免隨意服用水蛭製劑。因為水蛭作用較強，避免發生出血等不良反應。
清理血管主要是治療血栓類疾病，中醫認為此類疾病屬於血脈不通、瘀血阻絡，屬於淤血證範疇。常見的中藥包括紅花、雞血藤、丹參、赤芍、牛膝、桃仁等，還包括花草類，例如玫瑰花、山楂花等。
腦血栓面積大最壞的結果是患者可能會出現腦疝而導致死亡。由於人的大腦結構外包裹顱骨，而顱骨是密閉組織，只有通過頸部即腦幹與脊髓相連，此處存在一個開口，稱為枕骨大孔，並且通過此開口與脊髓相連。除此以外，其他部位均為密閉結構。