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漱口水可以祛除生理性口臭，但對於病理性口臭則無能為力。口臭在臨床上分為生理性口臭和病理性口臭，生理性口臭是指口腔和全身沒有任何疾病，在晨起時出現輕度口臭，此時通過漱口水漱口，可以祛除口臭，病理性口臭是由口腔或全身疾病而造成的口臭，通過漱口水漱口無效。
維生素B2對於某些原因引起的口臭，有一定的治療作用，但引起口臭的原因較為複雜，因此患者服用維生素B2以後，有可能能夠改善口臭，也有可能無效。維生素B2對口臭是否有改善作用，與導致口臭的原因有關，口臭常由於以下原因引起：
通常治療胃熱、口臭的中成藥，包括三黃片、清胃散、大黃黃連瀉心湯等藥物。這類藥物均具有清胃瀉熱的作用，對胃熱引起的口舌生瘡、牙齦腫痛、胃部灼熱、疼痛、胃部脹滿、納差、大便秘結、小便黃赤、舌紅、苔黃、脈數等症狀，具 有較好作用。
扁桃體手術之後，口臭約半個月會消失。扁桃體手術之後隨著病程的發展，積極抗炎治療漱口，大概1周，白膜會逐漸消失，炎症逐漸消退，咽黏膜腫脹也慢慢緩解，大概術後半個月，白膜消退完畢，炎症腫脹消退，這個階段口臭一般會消失。所以扁桃體術後患者，飲食為相當關鍵的一步，應按醫生的醫囑嚴格執行。
腺樣體、扁桃體術後如果漱口恰當，術腔沒有感染，通常不會產生口臭。產生口臭時如果漱口及時、恰當，應用合理的抗生素，通常第2天即可緩解。扁桃體、腺樣體，通過微創等離子射頻消融後，6-8個小時會在術區看到一層白膜形成，在此區域無法進行常規消毒。因此術腔清理主要依靠漱口，漱口時應將頭後仰，可以達到手術切除區域。
幽門螺桿菌感染會導致口臭，也是導致口臭十分常見的原因。所以對於有口臭的患者，應檢查是否存在口腔或耳鼻喉科疾病，若排除此類疾病，應考慮是否存在幽門螺桿菌感染或胃腸道疾病，可以做碳13或碳14呼氣試驗，查看是否存在幽門螺桿菌感染。對於存在幽 門螺桿菌感染的患者，通常可以採用四聯14天療法進行根除治療，需注意服藥期間避免飲酒、規律服藥、避免漏服，可以減少耐藥產生，從而提高根除率。