膠囊內鏡是一種特殊內鏡，僅比膠囊稍大，所以被稱為膠囊內鏡。膠囊內鏡被吞入胃內隨著消化道蠕動進行拍照觀察病變。膠囊內鏡主要用於小腸病變的檢查，因為常規胃鏡、腸鏡無法到達小腸，小腸一度被認為是胃腸鏡檢查未開墾的處女地，自從有膠囊內鏡後可以貫穿整個消化道。

隨著磁控膠囊內鏡誕生，利用外界磁力膠囊鏡頭可以旋轉，不僅可以觀察小腸，還可觀察胃。膠囊內鏡無需插管，且無交叉感染風險、無痛苦，受部分患者的青睞。對於不適合做胃鏡或者無痛胃鏡，或對胃鏡檢查恐懼、自身條件無法耐受胃鏡檢查者，可以使用膠囊內鏡作為胃或者小腸的檢查手段。