帶狀皰疹神經痛主要由於帶狀皰疹病毒侵犯神經，導致神經損傷所致。帶狀皰疹病毒是機體本身的一種病毒，在兒童時期呈現為水痘病毒，成年時期呈現為帶狀皰疹病毒，所以此病毒為水痘-帶狀皰疹病毒。此病毒一般聚集在身體背根神經節內，當機體抵抗力下降時，這種病毒被激活會侵犯和損傷相應的神經，出現相應神經分佈區的疼痛以及神經分佈區出現皮疹。

這種疼痛主要是由於皰疹是噬神經病毒，在神經的環境中汲取營養和生長，所以對神經會產生破壞作用。神經受到損傷後會出現神經病理性疼痛症狀，如陣發性電擊痛、針刺痛、痛覺過敏、痛覺超敏、疼痛異化和泛化等。