治療鵝口瘡首先要注意提高免疫功能，鵝口瘡是口腔感染白色念珠菌引起的，如不治療會加重的。可以買一些中成藥，如錫類散、冰硼散，用細小的管子把粉末吹入口中，一般能見效。可以口服一些抗黴菌的藥物，如制黴菌素、克黴唑進行綜合治療。

局部用藥對鵝口瘡是比較有治療效果的，可以用制黴菌素研成末，與魚肝油調勻塗抹在創面上，每4小時用1次藥，效果比較顯著。以下情況應及時送醫院，比如不願進食、輕度發熱、煩躁不安、發現口腔黏膜上乳凝塊東西向咽部蔓延，以防止斑塊脫落導致呼吸困難，在家中治療5-7天沒有改善，鵝口瘡越來越重，都應該及時的送醫院進行治療。