鵝口瘡好了之後也會復發。對於兒童來說，如果所接觸的口腔環境又恢復到之前，接觸了帶菌的碗筷或接觸到了帶菌的奶瓶或玩具，在這種情況下很容易復發。還有老年人在長期使用抗生素的情況下，因為抗生素長期使用，可能就不會戒斷抗生素。

再過段時間以後，隨著體質的需要，病情的需要，又使用抗生素了，由於其免疫力低下，也可能長期有癌症患者的病人，也可能就會再次復發。對於HIV感染的患者來說，由於全身的基礎疾病沒有改善，所以很快就又會復發。對於復發的患者來說就要分析，是由於什麼原因造成的復發。