非角化型鼻咽癌發病原因跟其它腫瘤相同，目前還沒有完全明確，在臨床上歸納因素主要有兩點，第一點是內因，第二點是外因。內因是遺傳易感性，有一定遺傳因素，臨床遇到過同卵雙胎，雙胞胎同時患鼻咽癌的案例報道，該病有種族和家族聚集現象。外因主要有以下方面：

1、環境因素：包括大環境和小環境，大環境包括大氣汙染、甲醛暴露、化學氣體、大氣灰塵等，是高危致病因素。

2、飲食因素：在鼻咽癌高發區的居民有食醃製品的習慣，因為這些食物含有較多的亞硝酸鹽，是1級致癌物，大米、活水中金屬鎳含量比較高，也是鼻咽癌的致癌因素。因此，飲食中一定要少吃醃製食品，少吃金屬含量超標的食物，才能夠避免鼻咽癌的發生。

3、EB病毒感染：如同肝癌是乙肝病毒感染一樣，屬於高危致病因素。