胃食管反流病患者可以服用的藥物，一種是抑酸劑，即質子泵抑制劑，目前常用的有奧美拉唑、艾司奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑及蘭索拉唑，輔助用藥包括促動力藥，如莫沙必利、伊託必利、馬來酸曲美布汀，或者是黏膜保護劑，稱為制酸劑，主要保護食道黏膜和胃黏膜，包括鋁碳酸鎂、鋁鎂加混懸液、複方鉍製劑，均可以作為黏膜保護劑，使其鋪在食道和胃表面。

患者常服用的藥物，主要是質子泵抑制劑，通過抑制胃酸，減少胃液量，減少對胃底的壓力，減少反流。其他兩種藥均作為輔助治療，通過試驗性治療，使用質子泵抑制劑，通常2周即可以起到明顯效果，如果有效證明有胃食管反流病，最好治療8周。國際、國內均建議服用質子泵抑制劑，目前最新指南，對於促動力藥和黏膜保護劑均有推薦，均可以緩解症狀，改善胃食管反流病。