腦電圖、核磁共振是兩種截然不同的檢測方法，腦電圖主要是針對腦電波的一種檢測方法，而磁共振主要是影像學的檢測方法。

但腦電圖主要適用於癲癇以及顱內感染，還有其它原因引起的各種中樞神經系統疾病，主要是通過不同的患者腦電波的異常來進行診斷和鑑別診斷，而磁共振是利用磁場來檢測影像學的變化，這兩種檢測的方法針對的性質不同，檢測的目的也不同。

一般磁共振對神經科來說，主要是看腦組織的結構，還可以觀察到是否有急性的中風，是否有腦出血，是否有佔位病變，還可以看到磁共振的血管成像，還有新興的功能磁共振用處非常廣泛，兩種方法檢測方法不同，目的完全不同。