菌陰肺結核也是需要治療的，只是菌陰肺結核可能傳染性不是很強，但是隻要確診為肺結核，都是需要規範長期的予以抗結核治療，而且療程要足，為6-9個月。

在規範的抗結核治療之後，也建議要複查肺部CT看病灶是否吸收好轉，同時也要查痰，看是否痰結核桿菌已經消失。肺結核主要是因為感染了結核分枝桿菌，而出現肺部的一種非特異性炎症，是一種急性呼吸道傳染病，主要是通過呼吸道飛沫傳播，發病主要決定於人體的免疫力。