部分咖啡斑胎記可以通過激光治療完全去除，是否能夠完全去除，需要經過醫生臨床評判或皮膚鏡相關檢查明確。多數患者經過多次激光治療可以取得較滿意的效果，大約有30%兒童經過激光治療，可以達到完全消除的目的。但大部分兒童經過多次激光治療不能完全消退，但可以使咖啡斑淡化。

難治性咖啡斑激光治療效果較差，可能經過4-5次，甚至5-6次的激光治療仍然無效，因此家長需要有一定心理準備，避免過高期望值，因為治療效果和兒童年齡、咖啡斑部位、咖啡斑顏色深淺及形狀有關，一般圓潤咖啡斑治療效果相對較差。