如果咖啡斑在生長，建議儘早治療，一般採取激光治療，需要多次治療才能把咖啡斑去除。咖啡斑是出生後隨著年齡的增大而增大，所以建議早治療，早治療後可減少痛苦，面積越小，激光治療時間會越短，面積越大，激光時間會越長，疼痛度也會增大。部分咖啡斑在生長過程中會顏色會越來越深，顏色越深，治療難度越大，治療次數會增加，明顯增加孩子疼痛。

如果全身咖啡斑較多，可能為神經纖維瘤，需要做基因檢測明確診斷。咖啡斑激光治療是否會復發很難判斷，部分咖啡斑表面觀察以清除乾淨，但可能後期復發，因為有時部分殘餘色素沒有肉眼觀察不到，並未清除乾淨。