鼻咽癌放療範圍包括鼻咽周圍的正常組織，顱底神經血管、肌肉，所以周圍的正常組織都會受到不同程度的照射。放療的副作用與照射範圍、照射劑量明顯相關。一般鼻咽根治性放療，周邊預防劑量最起碼在6000mg/m^2，很多正常組織會受到一定影響，最明顯的併發症是口腔黏膜反應，會出現口乾、味覺改變。

放療2個星期左右，會出現口腔黏膜叢集性水腫，嚴重者出現破潰，影響進食，上述是放療的急性反應。除急性反應外，晚期放療反應，如放療後幾個月甚至幾年出現口乾，經過半年左右逐漸減輕，但大部分患者不會完全恢復，還會有不同程度的口乾。另外，還有放射性反應，如神經損傷。