賁門癌術後化療根據國際國內指南的推薦，通常進行4-6次。常用的化療藥物主要為氟尿嘧啶類藥物，既有靜脈輸注的5-氟尿嘧啶，又有口服的藥物，如卡培他濱等。除此之外，對於賁門腫瘤還需聯合鉑類藥物，如順鉑、奧沙利鉑等。常用的賁門癌術後化療藥物全身治療，通常在賁門術後1個月開始進行，對於身體條件允許的患者，通常推薦2種藥物聯合應用。

應用的週期為4-6週期不等，主要取決於患者腫瘤的分期，即是否浸潤到了胃壁的全層、有無淋巴結轉移，淋巴結轉移的數目等因素。賁門癌手術之後化療的具體方案、藥物劑量或用藥週期，需術後患者與主管醫生進行詳細諮詢，根據手術後病理的情況、腫瘤增長的速度、分化的程度以及淋巴結轉移的情況，進行詳細規劃。