手術切除是小兒淋巴管瘤主要治療方式，對於某些瀰漫性生長手術無法切除或者手術切除極有可能會損傷重要器官、血管、神經組織的情況，可以採用局部注射硬化劑方法。體表淋巴管瘤治療方式是常規開放性手術治療，位於胸腔或者是腹腔的淋巴管瘤，比如大網膜淋巴管瘤可以通過腔鏡手段來完成手術。

淋巴管瘤治療時機選擇與淋巴管瘤生長部位和有無造成危害有關，對於只有局部小包塊而無其它不適症狀，可以等小孩長到3-6個月才手術。局部巨大的淋巴管瘤，特別是長在頸部估計可能會導致氣管壓迫、呼吸困難，導致小孩窒息建議儘早手術治療。