胰腺結節不一定為癌症，胰腺結節包含疾病非常多，需進行鑑別診斷。比如胰腺先天性異常，可於胰腺頭部、頸部、體部、尾部出現異常結節；還可能存在異位疾病，比如異位脾臟或出現在胰腺內的其它異位器官，也可以導致胰腺結節的出現。對於上述兩種情況，通常都是良性病變，也可以不進行處理。

另外的可能是病理性變化，首先是胰腺炎，局部也可以出現結節，而胰腺炎引起結節通常是良性；腫瘤性病變也可以出現結節，而腫瘤性疾病結節有可能是良性，也有可能是惡性，但良惡性的鑑別需進行進一步檢查。如果懷疑腫瘤是良性，做增強CT即可鑑別，比如可能是胰腺囊腫或胰腺實性假乳頭狀瘤。如果是癌，則需術前於超聲內鏡下活檢，並幫助診斷。超聲內鏡下活檢可以取組織進行病理學檢查，並進行定性診斷。