粒子植入治療是內照射治療，與外放射治療、伽瑪刀等都屬於放射性治療。粒子植入治療副作用相對較小，因此放療以後可以繼續補充粒子，如局部腫瘤復發可以再補充粒子，伽瑪刀患者可以再補充粒子。粒子植入副作用較小，可以安全使用。對於表淺的皮膚腫瘤，或鄰近危及器官，如腸道，建議粒子植入時距離皮膚表面或腸道1cm以上，避免出現局部組織壞死、破潰等。

雖然粒子照射範圍較小，但對於兒童、孕婦可能會有少量影響。因此建議一般正常情況下，粒子植入術後患者與孕婦、兒童保持在1m以外距離，儘量穿防輻射服以減少危害，對成人一般無影響。