臨床將腹瀉大體分為非感染性腹瀉和感染性腹瀉，鑑別常見如下：

1、非感染性腹瀉：患者食用不容易消化的食物，或藥物相關性、中暑後，均可能出現非感染性腹瀉。非感染性腹瀉通常也伴有脫水、電解質紊亂，但患者少有畏寒、發熱、白細胞升高，大便常規檢查中沒有紅細胞和白細胞。對於非感染性腹瀉的治療，臨床需積極補充液體，糾正電解質紊亂並補充益生菌，結合使用助消化的藥物，可能得到一定緩解；

2、感染性腹瀉：患者可能食用不潔的飲食或腸道本身出現感染，比如炎症性腸病合併病毒或細菌感染，此時的腹瀉常存在膿血便，而且患者伴有畏寒、發熱，大便檢查時常可見白細胞、輪狀病毒等。根據感染性腹瀉不同的病因，臨床需使用不同的治療方法，對於病毒感染所引起的腹瀉，便需要抗病毒治療，當然也需積極地進行補液治療。對於細菌感染引起的腹瀉，便需進行抗炎治療。不同的腹瀉病因，治療方案不同。