耳膜穿孔可由諸多原因引起，以外傷性鼓膜穿孔最常見，也較直接，多數是由於炎症引起的穿孔，比如中耳炎手術及鼓膜修補的對象均是炎症引起的鼓膜穿孔。穿孔較大，例如外傷的鼓膜穿孔，可在額鏡下觀察到；小穿孔在耳鏡下觀察不到，可在電耳鏡下放大觀察到；一些病變及更小的穿孔，例如膽脂瘤引起的穿孔，可在內耳鏡下清楚觀察到。