發作性睡病因為病因不明目前治療並無對因治療，僅有對症治療。針對發作性睡病不同症狀給予不同藥物進行治療，日間嗜睡為較主要症狀，可給予患者興奮類藥物進行治療，目前臨床較常用哌甲酯，國外還會應用莫達非尼、阿莫達非尼等新型興奮劑類藥物。

如果患者出現睡癱、睡眠幻覺可應用抗抑鬱藥或鎮靜安眠類藥物進行治療，患者夜間出現失眠或睡眠行為障礙可應用鎮靜安眠類藥物。如果同時伴有睡眠呼吸暫停建議患者儘量減肥、側臥，必要時應用家用呼吸機進行治療。因此發作性睡病治療需根據患者不同症狀，採取不同治療方案。