植物神經功能紊亂如果持續時間較長，本身可導致嚴重失眠。治療植物神經功能紊亂和失眠的情況，需要同時進行治療。如果只針對植物神經功能紊亂治療，沒有治療失眠，患者反覆失眠可能會加重，或者影響植物神經功能紊亂的治療，常見治療方式如下：
1、抗抑鬱和焦慮藥物：上述藥物可進行適當應用，在抗抑鬱和焦慮的藥物中常用米氮平或者曲唑酮等藥物，對於睡眠的改善有一定的幫助作用，同時又具有抗抑鬱和抗焦慮的作用；

2、安眠藥物：可短期應用安眠藥物，如苯二氮卓類藥物，比如阿普唑侖、艾司唑侖，非苯二氮卓類藥物，比如唑吡坦、右佐匹克隆、佐匹克隆等，屬於神經科對於抑鬱、焦慮、失眠的應用；

3、對症處理：對於合併心慌或者消化系統症狀，比如腹瀉、便秘等，需要進行對症處理，也可以運用經絡磁刺激、針灸，或者中成藥物等進行綜合治療，才能夠改善植物神經功能紊亂和失眠。