心肌梗塞介入治療有併發症，其中最嚴重的是血管破裂、出血、夾層，通常會出現在病變血管放支架或介入治療過程中。若出現心肌、血管穿孔，則可能會有心包積液、心包填塞，甚至有可能需要進行緊急心臟手術。但如果出血量較小，放完支架後出血得到控制，則無需進一步治療，引出積液後可逐漸痊癒。

另外，對於介入治療而言，因小型血栓往遠端脫落，造成無複流或者是慢血流現象，遠期效果可能也會受到影響，此為介入治療常見的併發症。