一般咽炎不能影響核酸檢測結果。咽炎為咽部黏膜瀰漫性的非特異性炎症，可以因上呼吸道感染而導致，可以為辛辣刺激性食物而誘發。另外外界環境汙染、惡性氣體的刺激，也容易引起咽炎。而核酸檢測是採取鼻腔或者咽部分泌物作為樣本，檢測感染病毒核酸是否存在，通常與咽炎沒有相關性。但臨床上容易出現核酸檢測的假陽性或假陰性，需要反覆取樣本和檢測，直到檢測結果一致，最後做出診斷。

咽炎在臨床較為常見，分為急性咽炎和急慢性咽炎。急性咽炎常繼發於上呼吸道感染，患者表現為咽痛、咽乾、發熱、全身痠痛等，一般應用抗生素及抗病毒治療效果良好，病程在1周左右。慢性咽炎的患者，表現為咽部堵塞感、咳嗽、痰多、異物感、燒灼感等，治療上採用清熱解毒的中成藥物以及局部治療，霧化吸入治療，通常效果良好。