肛門鏡可以查出直腸炎，但是肛門鏡的長度有限，在臨床檢查的時候用肛門鏡檢查，只能看到直腸下段的黏膜，臨床表現是下段黏膜充血、水腫或者有糜爛出血點、潰瘍點，甚至在肛門鏡底部可以看到黏液血，但是肛門鏡檢查不能完全看到直腸的全段。

所以直腸下段伴有炎症的患者，通過肛門鏡檢查可以明確診斷、但是肛門鏡沒有看到直腸炎情況，不代表患者就沒有這樣的症狀，因為肛門鏡檢查的範圍很有限，所以臨床上建議患者最好行電子腸鏡檢查，可以把全結腸以及直腸看的非常清楚。