根據不同的情況，高壓氧艙治療的時間不同。目前最主要的是常規治療，如腦出血、腦梗塞、腦外傷以後的康復治療，通常是兩小時。但是治療減壓病時，會根據下潛深度決定，可能要五小時。如果治療煤氣中毒，合適的壓力下需三小時左右。

除了治療時間外，還有療程的問題。如果是減壓病，治療一個療程就行。如果是康復性、定期做治療的患者，可能要做幾個療程，根據療程不同，治療時間需根據治療效果而定。高壓氧的常規治療時間是兩小時，但是治療時還包括升壓、減壓的時間，不應算在治療量裡，真正的吸氧時間可能為一小時左右。