口腔潰瘍不能用牙刷刷破，因為刷破只能加重潰瘍，且多數複發性口腔潰瘍的復發，也可能與牙刷刺破有一定相關性。所以出現口腔潰瘍時，主要的治療策略是保護潰瘍創面，促進潰瘍癒合，而並非通過機械的刺激加重潰瘍。

通常可在專業醫生的指導下，使用重組人表皮生長因子凝膠、口腔潰瘍膜，或曲安奈德口腔軟膏治療潰瘍。在沒有潰瘍時，還需對患者宣教，儘可能避免使用牙刷、硬物，或使用較硬、較脆的食物損傷口腔黏膜，以防形成潰瘍。